מוזיאון קרן חמש-המאות (500. Yıl Vakfı) נפתח במקור ב-2001 בבית הכנסת זולפאריס, ומאז דצמבר 2015 הוא שוכן במתחם נווה שלום עם תצוגה מעודכנת. המוזיאון פורש את המורשת ההיסטורית והתרבותית בת מאות השנים של יהודי טורקיה: תולדות הקהילה, אתנוגרפיה, חפצי פולחן, מנהגים ומעגל החיים. אולם ה"מִדְרָשׁ" מחבר פיזית בין המוזיאון לבית הכנסת ומאפשר לעיתים לצפות בטקסים דתיים חיים. הכניסה מתואמת בדרך כלל יחד עם הביקור בנווה שלום ובכפוף לנהלי הביטחון.